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 上海市水利工程协会于2013年1月18日召开成立大会，是上海市水利工程建设与管理等企、事业单位及其它相关组织和个人自愿结成的专业性、非营利性、全市性的行业自律组织。登记管理为上海市民政局，业务主管为上海市水务局。

      协会宗旨是团结广大会员遵守宪法、法律、法规，贯彻执行国家和地方有关方针政策；遵守社会道德风尚，促进社会主义物质文明与精神文明建设；发挥联系政府与会员之间的桥梁与纽带作用，维护会员合法权益，反映会员诉求；繁荣水利，服务大局，助力上海经济社会高质量发展。

      协会理事会常设办事机构为秘书处，负责协会日常工作开展。秘书处内部机构有综合办公室（财务部）、教育培训部、业务工作部。同时，成立了水利工程施工、水土保持、河湖养护、教育培训、材料设备、工程咨询、水闸运维等7个专业委员会、1个教育基地、1个水利职业技能等级认定中心。

 
      协会会员分为单位会员和个人会员。凡承认本会章程，自愿加入并积极支持和参与协会活动、在上海市内从事水利工程项目管理、勘察、设计、咨询、监理、施工、检测、运行、维修、养护、物资生产和供应等业务的企、事业单位及其它相关组织和个人，均可申请成为单位会员和个人会员。目前，协会已有单位会员572家，个人会员24人。
 
上海市水利工程协会于2021年11月26日召开了第三次会员代表大会暨第三届理事会第一次会议，选举产生了协会第三届领导机构。协会是4A级社会组织，为上海市水务局“文明单位”、上海市水务海洋系统“治水管海先锋”示范党组织。